Books Dr.Bonoの生命科学データ解析
オミックスデータの解析を主軸とした共同研究がいくつか走り出したので、生命科学のビッグデータに真正面から向き合う必要が生じました。たまたま１ヶ月前くらいに坊農さんの新しい本が上梓されていて、その内容が今の自分にぴったりすぎて、嬉しくてこの記事...
programming
Books Programming Rにインストールしてるパッケージ
Rを3.3にあげたらパッケージを全部入れ直しになったので備忘録的にコードをかいておく。
Books 久保拓弥さんの緑本
４月にラボをうつってから読み始めた久保拓弥さんの「データ解析のための統計モデリング入門」。とても読みやすくGLMMを勉強するための本として自分にとてもマッチしていました。もう何度も何度も読んでるけど、読むたびに、なるほど！！と勉強した気分に...
Programming knitrをつかって教材作った
FASTER論文のセミナーを依頼されたのでknitrで講義資料を作ってみた → faster.tutorial.pdf
また、オリジナルのRnwファイルもアップしておきます → faster.Rnw
ということで、明日、生まれ...
Programming ggplot2のレジェンドをguidesで少しだけ改造
ggplot2の備忘録。
Rにて数万というサンプルを散布図にするとレジェンドを書き換えたくなることがある。
サンプルデータを用意する。
PNGに保存するときはコメントアウトを外してください。
まずは普通に描画。
...
Programming Rとggplotでダブルプロットを作る
めちゃくちゃ久しぶりに備忘録。
Rにてダブルプロット。
ggplot2のgeom_rasterを使ってる。
こんなかんじ。
サンプルデータをかってにつくって、表示してみる。
Programming rglパッケージで3D散布図＆アニメーションをかく
久しぶりに備忘録。少し手を焼いたので。
Rで3D散布図。
rglパッケージは普通にインストール。
まずはデータ読み込み。ggplot2のmsleepデータセットを用いる。
plot3dコマンドで散布図作製。マウス...
Programming ggplot2でformatterを用いて軸ラベルを整形する
これも備忘録。いつも忘れてしまう。
まずはデフォルトのグラフ表示。
桁数を増やす。
Scientific表示。
組み込みのpercentもある。
Programming ggplot2でviewportを用いて1枚の画像に複数のplotを配置する
毎回ggplotで複数のグラフを1枚の画像に収めるときに調べてる気がするので備忘録的にアップ。リゲス本を参照。
Source code:
Rの基礎とプログラミング技法